骶尾部囊肿和骶尾部窦的病因一般认为有先天和后天二种原因。

　　①先天因素

　　a.胚胎异常：原因不确定。

　　b.神经起源说：即认为由髓管尾部剩件生成囊肿，在囊肿和窦的组织内可见神经组织，有的由于囊肿与神经管相连，可引起脑脊髓膜炎。

　　c.外胚层内陷说：即认为外胚层内皮表面向内凹陷，生成囊肿。

　　②后天因素：多认为是由于手术损伤、异物刺激和慢性感染引起的肉芽肿反应。

　　近年来，逐步认识到该病是由外部毛发而来的疾病，臀间裂有负吸引作用，可使脱落的毛发向皮下穿透。臀间裂内毛发过多过长，毛顶部有滤污和浸软皮肤的作用，毛穿入皮肤，形成短道，以后加深成窦；此外，毛根脱落到窦内也可使毛干穿透。在发病过程中有一半病例可见到毛发。因此，该病多见于多毛症、皮脂腺过度活动、臀间裂过深和臀部常受伤的患者，司机及野外作业的人常有此病的发生。